在酵母菌中进行生物合成途径查的自动化菌株构造
Maria C T Astolfi1,2,3, Sam D Yoder2,3, Marina Delfa-Lalaguna2,4
1Department of Bioengineering, University of California, Berkeley, Berkeley, California 94720, United States.
ACS synthetic biology
|October 9, 2025
概括
我们为合成生物学自动化了酵母菌株的构造,将吞吐量增加到每周2000次转换. 这条机器人管道加速了生物基础设施的发现和优化,用于途径工程.
科学领域:
- 合成生物学 合成生物学
- 生物工程是生物工程.
- 自动化和机器人技术
背景情况:
- 在合成生物学中,设计-构建-测试-学习 (DBTL) 循环通常受到手工菌株构造的限制.
- 将机器人自动化集成到合成生物学工作流程中,对于加速研发至关重要.
研究的目的:
- 提出一个模块化,集成的协议,用于自动化Saccharomyces cerevisiae菌株构建中的"构建"步骤.
- 为了实现高吞吐量选,以在生物基础设施中发现和优化途径.
主要方法:
- 编程一个汉密尔顿微实验室VANTAGE液体处理平台,以自动化酵母转换.
- 使用机器人臂集成甲板之外的硬件,以增强工作流的能力.
- 使用汉密尔顿VENUS软件开发一个可定制参数的用户界面.
主要成果:
- 每周实现了2000个酵母转换的吞吐量.
- 成功选了工程酵母菌株中的基因库,用于维拉生物合成.
- 确定了路径瓶和基因,这些基因可使维拉的产量增加2.0至5倍.
结论:
- 开发的自动化管道显著增加了酵母菌株构造的吞吐量.
- 该资源为生物发明中的合成生物学家提供了图书馆选的便利,有助于发现,优化和蛋白质工程的途径.
