深处的回声:揭示流感A病毒在水生生态系统中的持久性和微生物协会

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 病毒学 病毒学
• 生态生态学 生态生态学

背景情况:

• 甲型流感病毒 (IAV) 构成重大公共卫生威胁,在水生环境中具有复杂的传播动态.
• 在这些生态系统中,IAV的持久性,进化和微生物联系尚未得到充分理解.

研究的目的:

• 在中国东部的淡水和海水生态系统中研究IAV的遗传特征.
• 探索IAV与环境微生物之间的生态关联.

主要方法:

• 来自淡水和海水地点的水样的metatranscriptomic和metagenomic测序.
• 遗传学分析,种群动态评估和微生物协会网络建设.
• 统计分析包括塔吉马的D,Fu和Li的测试,以及PERMANOVA.

主要成果:

• 海水IAV碎片与最近的人类H3N2菌株相同;淡水碎片与历史的鸟类菌株一致.
• 在IAV和环境细菌 (例如,Brevundimonas aurantiaca) 和真菌 (例如,Thamnidium) 之间发现了显著的关联.
• 具有高Uroviricota丰度的淡水环境更频繁地检测到IAV,并且IAV阳性和阴性样本之间的微生物群落有所不同.

结论:

• 水生生态系统,特别是淡水生态系统,可以作为IAV持续性和进化的储.
• 微生物协会在病毒持久性中发挥作用,区域IAV起源表明迁徙水鸟参与其中.
• 对水生IAV的综合监测对于预测动物传染病风险和预防疫情至关重要.