通过多种生物信息算法识别和验证细胞衰老基因在复发性自发性流产中
Yiyun Wei1,2, Zhuolin Zhou3,4, Changqiang Wei1
1Department of Prenatal Diagnosis and Genetic Diseases Diagnosis, The First Affliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning, Guangxi, China.
Scientific reports
|October 10, 2025
概括
细胞衰老与复发性自发性流产 (RSA) 有关. 研究人员确定了三个关键基因 (TBX2,SRSF3,TNRC6B) 作为RSA的潜在生物标志物,为新的诊断和治疗策略铺平了道路.
科学领域:
- 生殖医学 生殖医学
- 基因组学就是基因组学.
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 复发性自发性流产 (RSA) 影响全球5%的夫妇,治疗疗效有限.
- 细胞衰老越来越被认为是各种疾病的一个因素.
- 细胞衰老在RSA病原体中的作用需要进一步研究.
研究的目的:
- 使用综合生物信息学方法识别与RSA相关的细胞衰老基因.
- 验证已识别的基因在转录组和蛋白质水平上的表达.
- 探索这些基因在RSA中的诊断和治疗潜力.
主要方法:
- 对两个RNA测序数据集的综合分析.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和五种机器学习算法 (XGBoost,Boruta,LASSO,SVM-RFE,随机森林).
- 使用qPCR,西斑,免疫光,人工神经网络 (ANN) 建模,功能丰富和单细胞RNA测序的验证.
主要成果:
- 鉴定了三个细胞衰老基因 (TBX2,SRSF3,TNRC6B),并发现它们在RSA患者中被上调.
- 这些基因参与MAPK信号传递,ECM受体相互作用和细胞间通信.
- 通过药物敏感性分析确定了RSA潜在的小分子治疗方法.
结论:
- 细胞衰老在RSA病理学中起着重要作用.
- TBX2,SRSF3和TNRC6B是RSA的潜在诊断生物标志物.
- 这项研究为开发RSA的新型诊断和治疗策略提供了基础.
