超重叠的tRNA长非编码RNA位点抑制了代码偏差基因

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学
• 在RNA生物学,RNA生物学.

背景情况:

• 大多数长非编码RNAs (lncRNAs) 的功能在很大程度上是未知的.
• 了解lncRNA的作用对于破译基因调节至关重要.
• lncRNAs因其多样化的调节功能而越来越受认可.

研究的目的:

• 描述一类新的 lncRNAs,称为tRNA重叠 lncRNAs (tROLs).
• 研究tROLs在软骨发育和基因表达中的作用.
• 阐明涉及tROLs,tRNA表达和蛋白质编码基因的调节机制.

主要方法:

• 在体外软骨发育过程中调高的tROL基因的识别和特征.
• 在tROL全基因删除后对基因表达变化的分析.
• 调控下调的基因中的子偏差的研究.
• 在tROL抑制或降解时评估tRNA表达水平.
• 对tROL位置的染色体相互作用分析.

主要成果:

• 在体外软骨发育过程中,tROL基因被上调.
• tROL删除改变了编码器偏差基因的表达,特别是那些具有与重叠tRNA相对应的编码器的基因.
• tROL位点位于基因密集区域,并表现出染色体间相互作用.
• tROL全基因删除导致邻近基因的上调.
• 对tROL转录的抑制或降解导致tRNA表达的减少.

结论:

• tROL位置集体运作,依靠相互转录来调节附近的基因和调节tRNA表达.
• tROLs作为非编码和编码基因组之间的监管联系.
• 这项研究揭示了tROLs在基因调节和tRNA平衡中之前未被描述的作用.