在Siniperca chuatsi对Aeromonas hydrophila和SNP发展的 irak1基因的表达分析
Yu-Xun Zhang1, Jin-Hua Gao1, Xiao-Li Yao1
1National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education (Shanghai Ocean University), Shanghai, 201306, China; Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resources, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Shanghai Ocean University, Shanghai, 201306, China; Shanghai Collaborative Innovation Center for Cultivating Elite Breeds and Green-culture of Aquaculture Animals, Shanghai, 201306, China.
Fish & shellfish immunology
|October 11, 2025
概括
在Siniperca chuatsi中,介素-1受体关联激酶1 (irak1) 基因在对抗Aeromonas hydrophila的天生的免疫力中起着至关重要的作用. 伊拉克1中的一个特定的SNP (SNP4) 与鱼类耐药性有显著的关联,为水产养殖提供了潜在的分子标志物.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 水产养殖是水产养殖的一种方式.
背景情况:
- 介素-1受体相关激酶1 (irak1) 对于鱼类的先天免疫非常重要.
- 了解 irak1 在 Siniperca chuatsi 中的作用对于疾病耐药性至关重要.
研究的目的:
- 为了分析Siniperca chuatsi中的 irak1基因.
- 调查 irak1表达及其与Aeromonas水菌感染的关联.
- 确定 irak1 中的单核酸多态 (SNPs) 和它们与疾病耐药性的联系.
主要方法:
- 对伊拉克的生物信息学分析1.
- 定量实时PCR用于基因表达造型.
- 双标签的 in situ 杂交用于空间定位.
- 桑格测序用于SNP识别和基因定型.
- 关联分析的奇二次测试.
主要成果:
- 锡尼珀卡 (Siniperca chuatsi irak1) 基因的完整长度为2264bp,包含死亡和PKC域.
- 在Aeromonas hydrophila感染后的头,和肝脏中, irak1的表达显著增加 (P < 0.05).
- 在肝脏中观察到 irak1 mRNA 和 Aeromonas hydrophila DNA 之间存在强烈的空间重叠.
- SNP4 (g.31029300 G>T) 显示出与对Aeromonas hydrophila (P = 0.003) 的耐药性具有高度显著的关联.
结论:
- 伊拉克1基因参与了Siniperca chuatsi中的Aeromonas hydrophila的免疫反应.
- 在Siniperca chuatsi繁殖计划中,SNP4代表了Aeromonas hydrophila耐药性的潜在分子标记物.
- 需要进一步的研究来阐明SNP4的特定功能作用.
