综合机器学习和转录基因分析识别了MNPN相关的口腔状细胞癌发病的关键分子标
Xiangjun Wang1, Panpan Jin1, Juan Xu1
1Department of Stomatology, The Third People's Hospital of Henan Province, Zhengzhou, China.
Frontiers in bioinformatics
|October 13, 2025
概括
贝特尔坚果的致癌物3 - - 甲基尼托萨米诺) 尼特 (MNPN) 在口腔癌中具有分子标. PLAU是MNPN相关的口腔状细胞癌 (OSCC) 的关键治疗点,具有很高的诊断潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 计算生物学 计算生物学
- 环境健康 环境健康
背景情况:
- 口腔状细胞癌 (OSCC) 是一个主要的全球健康问题.
- 贝特尔坚果的消费是OSCC的主要风险因素.
- 在OSCC病变发生过程中,3-甲胺 propionitrile (MNPN) 是贝特尔坚果的致癌物,其分子标尚未得到充分了解.
研究的目的:
- 在OSCC中全面描述MNPN的分子标.
- 确定MNPN相关的OSCC的潜在生物标志物和治疗点.
- 阐明了MNPN诱导的OSCC背后的分子机制.
主要方法:
- 综合性计算框架结合了目标预测,转录组分析和WGCNA.
- 来自基因表达大巴 (GEO) 的四个OSCC数据集的分析.
- 机器学习算法和SHAP分析用于生物标志物识别和模型解释性.
主要成果:
- 确定了881个潜在的MNPN目标和38个与OSCC重叠的基因.
- 发现了13个枢纽基因,其中PLAU显示了最高的预测性能 (AUC = 0.944).
- 确认PLAU和PLOD3是OSCC预测的关键贡献者;目标涉及异生菌反应和缺氧.
结论:
- 这项研究提供了MNPN相关的OSCC的第一个分子特征.
- PLAU被确定为MNPN诱导的OSCC的关键治疗和诊断目标.
- 这些发现支持针对贝特尔坚果致癌物相关的口腔癌的有针对性的干预措施.
