应用单细胞深度学习来阐明内脏和身体表面炎症模式之间的映射关系
Haixiang Huang1, Yeping Shi1, Bingbing Shen1
1College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu Province 210095, China.
Computational and structural biotechnology journal
|October 13, 2025
概括
皮下膜通过重编程巨细胞,在内脏炎症中起着关键作用. 这种带膜-内脏炎症交叉模式 (FVICP) 影响全身反应.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 连接组织生物学 连接组织生物学
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 皮下粘膜 (scFascia) 是一个广泛分布的结合组织.
- 它在内脏炎症期间的全身反应中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 研究scFascia在内脏炎症期间对全身反应的贡献.
- 为了阐明 scFascia 和内脏器官之间的通信通道.
主要方法:
- 沙门氏菌引起的痢疾的小鼠模型.
- 皮下附带膜单细胞RNA测序 (scRNA-seq). 皮下附带膜单细胞RNA测序 (scRNA-seq). 皮下附带膜单细胞RNA测序 (scRNA-seq). 皮下附带膜单细胞RNA测序 (scRNA-seq). 皮下附带膜单细胞RNA测序 (scRNA-seq). 皮下附带膜
- 基于深度神经网络 (DNN) 的非线性特征发现.
- 在PySCENIC分析中.
- 同文化测试. 同文化测试.
主要成果:
- scFascia巨细胞 (MPs) 呈现了类似瓦尔堡的代谢重编程和降低酸盐循环活性.
- 在scFascia中的Cd34+/Pdgfra+三角细胞 (CPTC) 通过Wnt/Fgf信号调节MP分化和增殖.
- CPTCs通过降低TLR4和CPT1A的调节,同时提高ATF4的调节来调节MP的炎症活性,并通过MTOR增强抗炎潜力.
- Fosl1,Nfkb2和Atf4转录因子被上调,导致MPs中的代谢和细胞周期变化.
结论:
- 在内脏炎症期间,scFascia有助于免疫调节和代谢重编程.
- 确定了一种涉及CPTC和MP的带膜-内脏炎症交叉通话模式 (FVICP).
- 在炎症期间,scFascia在维持全身平衡中发挥着重要作用.
