协调类图书馆使生物流体选择成为开发生物标志物测试的实用选择

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 临床化学 临床化学

背景情况:

• 选择最佳的生物流体对于在临床测试中准确评估生物标志物至关重要.
• 识别最适合候选生物标志物发现的生物流体可能是具有挑战性的.
• 现有的方法可能缺乏用于交叉生物流体生物标志物分析的标准化方法.

研究的目的:

• 开发和验证基于质谱学的工作流程,用于并行处理尿液,血和血清样本.
• 创建协调的类图书馆,以进行一致的监测和交叉流体规范化.
• 建立一个参考数据集 (CATalog) 以指导基于健康猫科动物蛋白质丰度的生物流体选择.

主要方法:

• 使用质谱法对猫的尿液,血和血清样本进行并行处理.
• 生物流体特异性库的开发和协调,以实现一致的监测.
• 创建CATalog数据库,用于对生物流体的蛋白质相对丰度分析.

主要成果:

• 展示了一种工作流,可以进行定量比较和的交叉流体正常化.
• CATalog数据集为猫类尿液,血和血清提供了相对蛋白质丰度数据.
• 探索血液和尿路蛋白质的可互换性,考虑样本处理和量化.

结论:

• 尿液有可能在某些蛋白质生物标记物应用中作为血液生物流体的替代品.
• 开发的工作流程和CATalog数据库有助于为发现猫类生物标志物进行知情的生物流体选择.
• 适当的样本处理是实现尿液潜力的关键,可以作为蛋白质分析的静脉穿刺的替代方案.