对预测软件对微囊素毒性评估的适用性进行比较分析
Cristiane Gonçalves da Silva1, Cristina Viana-Niero2, Marcelo Dutra Duque3
1Institute of Environmental, Chemical and Pharmaceutical Sciences, Federal University of São Paulo, Avenida Conceição 515, Diadema, SP, Brazil.
概括
In silico软件提供了一种具有成本效益的方法来预测蓝菌毒素 (microcystin) 毒性,减少动物试验. 它们包括ADMET预测器®,admetSAR和T.E.S.T. 软件在预测微囊毒性参数方面表现一致.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 计算化学是一种计算化学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 预测软件被广泛用于药物发现和化品安全性评估.
- 菌毒素,特别是微囊,具有明确的结构,但使用软件的毒性分析尚未得到充分研究.
- 目前评估新型微囊素变异的方法依赖于高毒性MC-LR的数据.
研究的目的:
- 评估和比较六个in silico预测软件工具,以分析它们在分析微囊素毒性的实用性.
- 为了确定哪个软件提供可靠的预测微囊素变体.
主要方法:
- 使用了四种微囊素变体的二维化学结构 (MC-LR,MC-RR,MC-YR,MC-HarHar).
- 评估了六种软件:ADMET Predictor®,ADMETlab,admetSAR,瑞士ADME,T.E.S.T. 和 ECOSAR. 这些软件包括:
- 评估了软件适用性领域和对脂性,透性和生物降解等参数的预测一致性.
主要成果:
- 它们包括ADMET预测器®,admetSAR,瑞士ADME和T.E.S.T. 足以预测关键的物理化学和环境参数.
- 它们包括ADMET预测器®,admetSAR和T.E.S.T. 与瑞士ADME相比,微囊素毒性预测的一致性更高.
- ADMET Predictor®提供了最多的有效预测模型 (超过70个).
结论:
- 在 silico 软件中,当对适用性领域进行验证时,在区分微囊素变异毒性方面显示出显著的希望.
- 这种方法提供了快速,可重复和具有成本效益的毒性数据生成,可能减少动物使用.
- 该研究强调了特定的软件工具,适用于可靠的微囊素毒性评估.
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