全基因组协会研究揭示了黄瓜 (Cucumis sativus) 中细菌角叶斑抗性的候选基因

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 遗传学 遗传学 是一个
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 细菌角叶斑 (BALS),是由*Pseudomonas amygdali* pv.引起的 虫 (lachrymans) 是对黄瓜生产的重大威胁,导致大量的产量损失.
• 有限的研究存在于黄瓜对BALS的耐药性的遗传基础上,阻碍了育种工作.

研究的目的:

• 为了确定与黄瓜BALS耐药性相关的遗传位置.
• 确定参与黄瓜对细菌防御的候选基因.角状叶斑.

主要方法:

• 全基因组关联研究 (GWAS) 在126个黄瓜加入中使用超过160万个单核酸多态 (SNP).
• 在两个生长季节中评估BALS抗性.
• 基因注释,序列对齐,单元型分析和定量实时PCR (qRT-PCR) 用于候选基因验证.

主要成果:

• 在两个季节中确定了两个稳定的耐药性位点,gBALS4.1和gBALS6.1*.
• 他们确定了三个候选基因: *CsaV3_4G024870* (与LEA蛋白相关), *CsaV3_6G042860* (辅因子硫酶) 和 *CsaV3_6G042910* (酸结合蛋白2-类似).
• *CsaV3_4G024870*和*CsaV3_4G042910*在注射后的耐药线上显示上调,而*CsaV3_6G042860*在敏感线上显示上调.

结论:

• 这项研究阐明了黄瓜中BALS耐药性的遗传结构.
• 已识别的位点和候选基因为BALS耐药黄瓜品种的标记器辅助育种提供了有价值的标.
• 促进了黄瓜品种的发展,增强了对细菌角叶斑的抵抗力.