用Bromelain准SARS-CoV-2变种:使用对接,分子动态模拟和MM-PBSA进行Spike-ACE2抑制的in-silico研究
Palash Ahuja1, Lawanya Rao1, Norine Dsouza1
1Department of Biotechnology, St. Xavier's College, Mumbai, Maharashtra India.
In silico pharmacology
|October 20, 2025
概括
布罗梅林显示出作为对抗SARS-CoV-2变种的竞争性抑制剂的潜力,包括JN.1.1和JN.1.4. 这种植物衍生的蛋白酶有效地与尖蛋白结合.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 继续演变,构成全球健康威胁.
- SARS-CoV-2尖端蛋白与ACE2受体的相互作用对于病毒进入至关重要,也是关键的治疗标.
- 来自的蛋白酶布罗梅林已经证明了抗病毒性质.
研究的目的:
- 研究布罗梅林作为SARS-CoV-2尖端蛋白与ACE2结合的竞争性抑制剂的潜力.
- 分析布罗梅林与来自各种SARS-CoV-2变体的尖端蛋白受体结合域 (RBD) 的相互作用,包括武汉,三角洲,奥米克朗,JN.1.1和JN.1.4.4.
主要方法:
- 来自流行SARS-CoV-2变种的RBDs的序列分析.
- 分子对接研究,以评估Bromelain与RBD内的ACE2位点的结合.
- 分子动力学模拟和MM/PBSA计算以验证结合稳定性和亲和力.
主要成果:
- 梅林在RBD中占据了ACE2结合位,抑制百分比在变体之间从42.1%到68.42%不等.
- JN.1.1 和 JN.1.4 呈现出显著的序列变化.
- 分子动力学和结合能量的计算证实了稳定的相互作用,布罗梅林对JN.1.4变种表现出最强的亲和力.
结论:
- 梅林作为ACE2与SARS-CoV-2尖端蛋白结合的竞争性抑制剂.
- 布罗梅林显示出作为抗病毒剂对新出现的SARS-CoV-2变种的显著潜力,特别是JN.1.1和JN.1.4.
- 需要进一步的体外和体内研究来证实布罗梅林的治疗疗效.
