基于批量和单细胞转录组学的肝细胞癌中NETs相关基因的预后签名
Ningning Lu1, Zhixia Gu2,3,4,5, Xiaoxue Yuan2,3,4,5
1Interventional Therapy Center for Oncology, Beijing You'an Hospital, Capital Medical University, Beijing, 100015, People's Republic of China.
Journal of hepatocellular carcinoma
|October 21, 2025
概括
中性细胞外细胞陷 (NETs) 影响肝细胞癌 (HCC) 的进展. 这项研究确定了与NETs相关的基因,包括GAS2L3,作为HCC的关键预后因素,提供了潜在的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 炎症和中性粒细胞外细胞陷 (NETs) 涉及瘤发育,转移和免疫抑制.
- 在肝细胞癌 (HCC) 免疫力中,NET相关基因的特定作用仍然在很大程度上未被描述.
研究的目的:
- 识别与NETs相关的基因特征及其在HCC中的预后价值.
- 开发基于NETs相关基因的HCC生存预测模型.
主要方法:
- 综合单细胞RNA测序和癌症基因组图谱 (TCGA) 的转录数据.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),LASSO-COX回归,以及用于预后分析的诺姆图构造.
- 在体外测试 (EdU,CCK-8) 以验证已识别的基因在HCC细胞增殖中的作用.
主要成果:
- 在高和低NETs组之间观察到显著的生存差异.
- 验证了GAS2L3和RTN3作为HCC的独立预后因素.
- 纳入NETs风险评分的nomogram显示出强大的预后性能;高风险的HCC显示了丰富的生物合成途径和更高的突变率.
结论:
- 多omics分析在HCC中确定了NETs相关的预后特征.
- GAS2L3是一个关键的基因,将NET与HCC进展联系起来,并具有治疗潜力.
