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Updated: Jan 14, 2026
09:05
Pooled CRISPR-Based Genetic Screens in Mammalian Cells
Published on: September 4, 2019
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敲门地图:一个网络资源,用于人和小鼠细胞系中CRISPR/Cas9的向蛋白质陷
Yuma Hanai1, Patrick Louis Lagman Hilario1, Yuriko Shiraishi1
1Laboratory of RNA Molecular Medicine, Nara Institute of Science and Technology, Takayama 8916-5 Ikoma Nara 630-0192, Japan.
Nucleic acids research
|October 21, 2025
概括
敲进地图提供了一个宝贵的资源,用于使用CRISPR-Cas9技术创建基因敲进细胞系. 这个网络资源促进了用光蛋白进行基因标记,有助于细胞工程研究.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 克里斯普尔-Cas9技术使细胞工程成为可能,但大规模的向基因敲门资源有限.
- 有效和可复制的基因敲门对于各种生物研究至关重要.
研究的目的:
- 介绍Knock-in Atlas,这是一个通过光蛋白敲进来标记基因的网络资源.
- 提供指导RNA (gRNA) 和特征性敲进细胞系的精选数据库.
主要方法:
- 通过将人工外因子插入目标基因内因子,开发出敲进细胞系.
- 根据疗效得分和蛋白质结构,选择和编目指导RNA (gRNAs).
- 通过流动细胞计,共聚焦显微镜和西部涂抹来表征敲进细胞系.
主要成果:
- 创建了350种蛋白质的敲进细胞系,重点是RNA结合蛋白.
- 针对多个细胞系 (HEK293T,eHAP1,HeLa,THP-1,Neuro2a,MEF,mESC) 的转染和流细胞测量协议进行了优化.
- 启动了一个网站 (https://rnabio.naist.jp/atlas/),共享表征数据和预先设计的gRNA信息.
结论:
- 敲进地图表作为一个可扩展的资源,用于生成基因敲进细胞系.
- 这个资源帮助研究人员在细胞工程和功能基因组学研究.
- 精心策划的gRNA数据库和特征化的细胞系加速了人类和小鼠遗传学的研究.
