在母体血液中检测胎儿cfDNA

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 下一代测序 (NGS) 试验对于分析母体血中无细胞DNA (cfDNA) 是至关重要的.
• 准确的胎儿遗传信息的产前预测,如血型,对于管理怀孕至关重要,特别是在母亲免疫接种的情况下.
• 在产前诊断中尽量减少假阴性结果对于可靠的患者管理至关重要.

研究的目的:

• 开发和验证一种基于NGS的测定方法,用于检测母体血内的胎儿cfDNA中的父遗传遗传变异.
• 通过尽量减少假阴性结果,提高免疫孕妇产前血型预测的准确性.
• 建立一种可靠的方法来确定胎儿cfDNA的存在或不存在,从而提高诊断确定性.

主要方法:

• 使用多重PCR试验结合多个遗传标记 (删除插入变异) 来区分母体和胎儿cfDNA.
• 采用SQL算法从gnomAD v3数据库中选择信息性遗传标记,重点关注跨多种种族人口频率接近0.5的等位基因.
• 开发了一个评分算法,并根据实验测试来解释测试结果,建立了一个切断值 (<0.15%).

主要成果:

• 该试验成功确定了父亲遗传的遗传变异的存在,而不需要先前了解母亲或父亲的基因型.
• 一个由22个双基删除插入 (delin) 标记器组成的小组,每一个都位于单独的染色体上,在99%以上的病例中提供了信息性的结果.
• 开发的评分算法和切断值可靠地区分了母体和胎儿cfDNA的存在.

结论:

• 开发的试验准确地估计了母亲血中非自身遗传变异的存在,特别是胎儿cfDNA.
• 这种测试作为对胎儿cfDNA存在的关键控制,从而提高下游产前遗传分析的可靠性.
• 该方法可能具有更广泛的应用在检测非自我遗传材料超出其主要用途在胎儿cfDNA分析.