在DESS中存储环境温度支持对犬虫蛋的本齐米达抗性的分子研究

科学领域:

• 兽医寄生虫学 兽医寄生虫学
• 分子诊断学 分子诊断
• 它具有对虫的抵抗力.

背景情况:

• 狗虫对本齐米达的耐药性是一个重要的兽医和公共卫生问题.
• 耐药性监测的分子诊断通常需要冷藏的便样本,限制了现场应用.
• 准确检测与耐药性相关的突变对于有效的控制策略至关重要.

研究的目的:

• 评估二甲基硫氧化物,EDTA和和NaCl (DESS) 作为犬样本的室温保存介质.
• 评估DESS保存对DNA完整性和虫分子检测诊断性能的影响.
• 为了将DESS保存的样本与冷藏的对照进行比较,用于分子寄生虫学应用.

主要方法:

• 狗便样本使用DESS在室温下保存长达106天.
• 用ITS-2rDNA和同型-1β-tubulin基因 (tubb-1) amplicon metabarcoding进行了DNA完整性和诊断性能评估.
• 将PCR放大,测序结果和检测与耐药性相关的单核酸多态 (SNP) 进行了DESS保存和冷藏样本之间的比较.

主要成果:

• 在DESS保存和冷藏样品之间没有观察到PCR放大或测序结果的显著差异.
• DESS能够可靠地检测虫物种和与耐药性相关的SNP,包括tubb-1基因中的F167Y.
• 突变频率在DESS保存持续时间和与冷藏对照相比是一致的.

结论:

• DESS是一种强大而有效的介质,用于在室温下保存犬便样本,用于分子寄生虫学.
• 这种保存方法消除了对冷链物流的需求,促进了从偏远环境收集样本.
• 在现场条件下,DESS支持扩大对狗虫抗甲虫药物耐药性的监测.