坎比洛巴克特种的分布和特征. 在屠宰时的火中

科学领域:

• 食品安全和兽医微生物学
• 抗微生物药物耐药性的监测监测
• 细菌基因组学是一种细菌基因组学.

背景情况:

• 坎比洛巴克是人类细菌性食物传播疾病的主要原因.
• 禽类,特别是火,是坎皮洛巴克特菌的重要储存库.
• 之前的研究表明,来自火的坎皮洛巴克特菌分离物中存在高抗微生物耐药性.

研究的目的:

• 调查2013-2023年芬兰屠宰火中Campylobacter的流行情况.
• 通过全基因组测序来表征Campylobacter分离体,重点关注物种,耐药性概况和遗传相关性.
• 评估这些隔离物中抗菌素耐药性基因的发生情况.

主要方法:

• 来自芬兰一家火屠宰场 (1856个群,41个农场) 的监测数据分析.
• 从火便样本中获得的103个坎皮洛巴克特分离体的全基因组测序 (2013-2021年).
• 细菌物种,抗微生物耐药性基因,序列类型 (ST) 和核心基因组等位基因配置文件的识别.

主要成果:

• 在9.5%的群体和82.9%的农场中检测到坎皮洛巴克特菌,其流行率因年,月份和农场而异.
• 坎比洛巴克特 (Campylobacter jejuni) 是主要的物种 (87.6%),其次是大肠杆菌和C. lari. lari.
• 确定了34种序列类型,其中ST45是最常见的 (20.2%). 密切相关的分离物与相同的农场和时间段有关.
• 大多数隔离物具有较低的抗微生物耐药性,主要仅携带blaOXA基因.

结论:

• 芬兰屠宰火中坎皮洛巴克特菌的流行率和抗菌素耐药性基因的发生率很低.
• 坎皮洛巴克特在同一农场内的群体之间传播,但特定的序列类型不会持续存在.
• 调查结果强调了农场层面监测对于控制坎皮洛巴克特传播的重要性.