在澳大利亚收集的陆地牛的RNA-seq数据集
Berenice Talamantes-Becerra1,2, Wei-Shan Chang2, Michelle Michie2
1Australian e-Health Research Centre, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Acton, ACT 2601, Australia.
Data in brief
|October 27, 2025
概括
这项研究介绍了来自澳大利亚陆的RNA测序数据,它们是各种病原体的关键宿主. 该数据集支持对非模型无脊椎动物的疾病传播,保护和生物信息学的研究.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 基因组学就是基因组学.
- 寄生虫学的寄生虫学
背景情况:
- 牛作为医疗和兽医重要寄生虫和病原体的宿主.
- 了解牛生物学对于疾病传播研究和生态研究至关重要.
- 陆地牛表现出多样化的饮食,影响其在生态系统中的作用.
研究的目的:
- 为了生成和提供来自澳大利亚陆地陆地牛的原始RNA测序数据.
- 将汇集的转录基因数据公开提供,以便在各种研究领域重复使用.
- 促进对宿主-病原体相互作用和非模型无脊椎动物转录组学的研究.
主要方法:
- 从澳大利亚三个地方收集了10只陆地地牛.
- 使用Maxwell® RSC的简单RNA组织套件提取RNA.
- 进行RNA测序,平均每样本产生5600万个对结读.
主要成果:
- 原始RNA-seq读取并组装在DRYAD中存储的转录 (主机和非主机).
- 还提供了组装的仅为主机的转录.
- 为环境和生物研究创建了一个全面的数据集.
结论:
- 该数据集为环境研究提供了巨大的潜力,包括保护生物学和入侵物种监测.
- 它可以用于疾病研究,教育目的和开发生物信息工具.
- 这些数据对于对非模型无脊椎动物的metatranscriptomic分类工具进行基准测试是有价值的.


