综合性多组体分析在体内识别流感病毒宿主因素
Leah P Shriver1,2,3, Benjamin J Polacco4,5,6, Manon Eckhardt4,5,6
1Department of Chemistry, Washington University in Saint Louis, Saint Louis, MO 63130, USA.
iScience
|October 27, 2025
概括
流感病毒感染改变了宿主细胞的过程. 研究人员确定了氨酸:糖氨酸氨基转移酶 (GATM) 作为一个关键因素,并阻止它减少病毒病理和炎症.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 系统生物学 系统生物学
- 宿主-病原体相互作用
背景情况:
- 流感A病毒 (IAV) 感染显著影响宿主细胞功能,以促进病毒复制.
- 了解IAV对宿主因子调制的理解对于识别治疗点来对抗病毒病原性至关重要.
研究的目的:
- 通过多omics方法全面分析宿主对IAV感染的反应.
- 为了确定新的宿主依赖因素和途径,对IAV复制和病变产生至关重要.
主要方法:
- 用H1N1和H5N1 IAV菌株感染小鼠,然后对肺组织进行多omics分析.
- 应用网络传播分析来识别因感染而改变的宿主模块.
- 开发和利用MidTOD计算管道来整合多omics和代谢数据.
主要成果:
- 通过IAV感染显著改变的24个不同的宿主模块 (2920个基因/蛋白质) 的识别.
- 整合了多个omics数据,发现了线粒体和过氧体代谢的显著变化.
- 氨酸:甘氨酸胺基转移酶 (GATM) 被确定为人类细胞和小鼠的关键宿主依赖因子.
结论:
- IAV感染诱导了广泛的宿主细胞和代谢重编程.
- GATM在IAV的发病过程中起着重要作用,其抑制可以减少病毒病理和炎症反应.
- 这项研究提供了一个集成的,系统层面的IAV-主机相互作用的理解,并突出了GATM作为潜在的治疗目标.
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