一种多方面的方法来识别临灭绝的massaasauga蛇的疾病反应基因

科学领域:

• 保护遗传学 保护遗传学
• 进化生物学是进化的生物学.
• 野生动物疾病是野生动物疾病.

背景情况:

• 疾病严重威胁到危物种的长期生存.
• 疾病反应基因的遗传变异是关键,但在罕见物种中识别这些基因是具有挑战性的.
• 蛇真菌病 (SFD) 是对蛇的新兴威胁,包括东部马萨萨加蛇 (Sistrurus catenatus).

研究的目的:

• 为了确定参与疾病反应和耐药性的候选基因,在临灭绝的东部大蛇 (Sistrurus catenatus) 中.
• 调查人口规模和遗传漂移对检测疾病抵抗基因功能变异的影响.
• 评估候选疾病反应基因中非中性进化的模式.

主要方法:

• 作为应对蛇真菌病 (SFD) 挑战的差异基因表达分析.
• 异常测试 (核酸多样性,塔吉马的D,FST) 检测候选基因的非中性进化.
• 两种S. catenatus种群和一种相关物种 (S. tergeminus) 的比较分析.

主要成果:

• 与其姐妹物种相比,在S. catenatus中观察到功能部位的遗传多样性减少.
• 在较小的S. catenatus种群中,遗传漂移使发现异常基因变得复杂.
• FST异常测试确定了候选蛋白质编码基因,可能与疾病反应的局部适应有关.
• 鉴定了218个候选基因,它们在对疾病的反应中具有差异性表达,含有与疾病耐药性相关的功能变异.

结论:

• 这项研究在东部马萨萨古拉蛇中确定了许多对疾病耐药性的候选基因,这对保护工作至关重要.
• 遗传漂移显著影响到检测适应性变异的能力,在危物种的小种群.
• 这些发现强调了考虑种群遗传学的重要性,以了解物种对疾病的抵抗力.