针对甲状腺受体受体的RNA吸收体候选人的in silico开发

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 计算化学的计算化学

背景情况:

• 胺是短的寡核酸,对分子标具有很高的亲和力和特异性.
• 常规的aptamer选择方法是通过指数式丰富 (SELEX) 的联体的系统演化.
• 甲状腺激素受体 (TRs) 调节基因表达,并与甲状腺功能障碍等代谢障碍有关.

研究的目的:

• 开发一种非SELEX的,用于体发现的in silico策略.
• 为了识别抗核甲状腺激素受体 (TRs) 的RNA吸附体.
• 评估已识别的aptamers作为甲状腺功能增强症治疗剂的潜力.

主要方法:

• 在aptamer合成和亲和度评估的in silico模拟.
• 基于知识的甲状腺激素反应元素 (TREs) 的检索.
• 预测RNA结构,分子对接和分子动力学模拟.

主要成果:

• 通过计算识别了几种具有强大的结合亲和力与TRs的单链RNA吸附体.
• 一个候选的胺体显示出与甲状腺激素受体α的特别有利的相互作用.
• 已识别的胺酶通过抑制TR-TRE相互作用,作为潜在的抗体起作用.

结论:

• 一种新的in silico方法成功地确定了针对TRs的潜在RNA吸收体.
• 一种候选的阿巴胺体显示出作为甲状腺功能增强症治疗剂的潜力.
• 需要进行实验验证,以证实已识别的阿普坦酶作为TR阻断分子的有效性.