现实世界ctDNA NGS分析的技术障碍:从临床实施中吸取教训
Simon Cabello-Aguilar1,2, Julie A Vendrell1, Jérôme Solassol1,3
1Laboratoire de Biologie des Tumeurs Solides, CHU Montpellier, Université de Montpellier, 34295 Montpellier, France.
Diseases (Basel, Switzerland)
|October 28, 2025
概括
循环瘤DNA (ctDNA) 的下一代测序提供了一种微创的癌症检测方法. 检测极限和生物信息学的改进可以提高其临床实用性和准确性.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 通过下一代测序 (NGS) 进行循环瘤DNA (ctDNA) 分析,提供了用于癌症检测和监测的最小侵入性方法.
- 使用ctDNA的液体活检提供了对瘤异质性的实时基因组见解,有助于早期检测和治疗反应评估.
- 由于缺乏标准化的ctDNA量化和对低频变异的敏感性有限,临床实施面临挑战.
研究的目的:
- 讨论提高ctDNA分析灵敏度和可靠性的关键改进.
- 为更广泛的临床采用解决当前ctDNA检测方法的局限性.
- 探索生物信息学的进步,以更准确地检测ctDNA变体.
主要方法:
- 将ctDNA变异的检测极限 (LoD) 从0.5%降至0.1%.
- 实施基于测序深度的动态LoD方法,以提高可靠性.
- 使用具有"允许"和"阻止"列表的战略生物信息管道来提高准确性并最大限度地减少假阳性.
主要成果:
- 从0.5%降低到0.1%的LoD可以将变化检测率从50%提高到大约80%.
- 动态LoD方法提高了ctDNA分析的可靠性和临床解释信心.
- 战略生物信息学管道提高了ctDNA变异识别的准确性并减少了虚假阳性.
结论:
- 解决ctDNA量化标准化和检测灵敏度限制对于临床整合至关重要.
- 技术进步和标准化协议可以加速在常规癌症护理中使用ctDNA分析.
- 改进的ctDNA分析有可能改变癌症管理并降低医疗保健成本.


