动态泌尿蛋白质组学集成了单细胞和空间转录组学,揭示瘤微环境并预测胆道癌症免疫治疗反应
Shanshan Wang1,2, Zhengguang Guo3, Boyu Sun1
1Department of Liver Surgery, State Key Laboratory of Complex Severe and Rare Diseases, Peking Union Medical College Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College (CAMS & PUMC), Beijing, China.
Gut
|October 28, 2025
概括
泌尿蛋白质学可以预测胆道癌症 (BTC) 的免疫检查点抑制剂 (ICI) 反应. 一个新的4蛋白小组提供了一种非侵入性方法来识别可能受益于ICI治疗的患者.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- 大多数胆道癌症患者缺乏免疫检查点抑制剂 (ICI) 的持久益处.
- 预测性生物标志物对于BTC的ICI治疗迫切需要.
- 泌尿蛋白质组学是一种尚未探索的非侵入性方法,用于ICI治疗癌症中的生物标志物发现.
研究的目的:
- 建立泌尿蛋白质组作为BTC中ICI响应的预测工具.
- 研究尿路蛋白质组形状,瘤动态和瘤微环境 (TME) 改造之间的关系.
- 为了确定新的尿路生物标志物来预测ICI的持久临床益处 (DCB).
主要方法:
- 一个发现-验证蛋白质组学工作流使用质谱 (MS) 在211个尿样从97个治疗-naiveBTC患者接受ICI治疗.
- 基于基线蛋白质特征的机器学习模型的开发,用于ICI响应预测.
- 单细胞和空间转录组的整合,以将尿蛋白组与TME特征相关联.
主要成果:
- 患有DCB的患者表现出免疫激活和炎症通路的丰富,而非响应者则有前瘤原生过程.
- 纵向的尿路蛋白质变化反映了TME重塑和瘤进化.
- 一个4-尿蛋白面板 (PTPN13,SUB1,MICAL-L1,VARS1) 准确地预测了DCB和早期反应,得到了外部验证.
- PTPN13+恶性细胞与前性TME状态和持续的ICI响应性有关.
结论:
- 这项研究引入了尿蛋白学作为免疫瘤学的先进的非侵入性方法,用于预测和监测BTC中的ICI反应.
- 尿蛋白质组分析提供了对TME动态和ICI疗效的机制性见解.
- 开发的4蛋白小组显示了临床应用的潜力,用于指导BTC患者的ICI治疗决策.
