采用MSB选择性丰富,然后采用AMPLICON MINION测序来检测吸烟鱼中的多种病原体
Ana Costa-Ribeiro1,2, Alexandre Lamas3, Marta Prado1,3
1International Iberian Nanotechnology Laboratory, Braga, Portugal.
NPJ science of food
|October 29, 2025
概括
一种新方法使用下一代测序 (NGS) 快速检测多种食物传播的病原体. 这种方法简化了复杂的生物信息学,为食品安全测试提供了可靠的工具.
科学领域:
- 食品安全和微生物学
- 基因组技术 基因组技术
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 全球每年都有数以百万计的食物感染.
- 下一代测序 (NGS) 为病原体检测提供了一个有前途的途径.
研究的目的:
- 开发和评估一种基于NGS的新方法,用于同时检测多种食源性病原体.
- 为了简化通常与NGS相关的复杂生物信息分析.
主要方法:
- 使用了一种新的选择性缩.
- 用经过验证的原料进行了多重PCR.
- 使用长时间读取的Flongle MinION测序,然后在三个基于云的管道中进行分析.
主要成果:
- 该方法准确地检测出沙门氏菌,大肠杆菌O157:H7和L. monocytogenes在刺的鱼样本中.
- 关键病原体的检测极限低于10 CFU/25g.
- 在所有生物信息管道中观察到高灵敏度,特异性和精度 (>90%),一致性值为0.91.0.0.
结论:
- 开发的方法提供了一种简单可靠的方法,用于在食品传播病原体检测中实施NGS.
- 这种技术简化了测试,克服了NGS技术在食品安全应用中的常见局限性.


