致病性ESR2编码和UTR变体作为激素依赖癌症中的致癌潜在生物标志物的形特征
Hakeemah Al-Nakhle1,2, Zainab Almoerifi1, Layan Alharbi1
1Department of Clinical Laboratory Sciences, College of Applied Medical Sciences, Taibah University, Madinah 42353, Saudi Arabia.
Genes
|October 29, 2025
概括
研究雌激素受体-β1 (ERβ1) 基因变异发现了许多有害突变,影响了ERβ1的稳定性和功能. 这些ESR2变体显示出瘤类型特定的临床效应,突出显示了它们作为生物标志物的潜力.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 遗传学和基因组学
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- ESR2基因编码雌激素受体-β1 (ERβ1),这是激素依赖癌症的关键参与者.
- 包括非同义SNP (nsSNP) 和非翻译区域 (UTR) 变异在内的ESR2遗传变异的功能影响尚不清楚.
研究的目的:
- 进行ESR2变异的in silico评估,以预测它们的致病性,致癌性以及对ERβ1结构和功能的影响.
- 评估乳腺 (BRCA),子宫内膜 (UCEC) 和卵巢 (OV) 癌症中ESR2变异的临床相关性.
主要方法:
- 用于变体检索和多种生物信息学工具 (PredictSNP,I-Mutant,MUpro,HOPE,MutPred2,CScape) 进行病原性和稳定性预测.
- 使用STRING,KEGG和GO进行路径分析;RegulomeDB和polymiRTS用于监管效应;cBioPortal用于泛癌生存分析.
- 评估了nsSNP对ERβ1域,辅因子招募和转录后调节的影响,包括miRNA结合.
主要成果:
- 确定了93个持续有害的误解nsSNP,其中几个预计会破坏ERβ1的稳定性,特别是在联体结合 (LBD) 和DNA结合 (DBD) 域中.
- 发现了潜在的致癌驱动因素 (R198P,D154N),其种群频率较低,预计会破坏联合激活剂结合和转录相互作用.
- 观察到瘤类型特定的临床关联:BRCA的整体存活率 (OS) 较差,但ESR2-改变病例的UCEC和OV的OS更好.
结论:
- 这种综合性分析优先考虑影响ERβ1结构和功能的高影响ESR2变体.
- ESR2变体表现出上下文依赖的临床效应,对生物标志物的发展有潜在影响.
- 需要进一步验证,以将特定的变异类与治疗应用的ERβ表达和生存结果联系起来.
