建立基于糖转移酶基因的清细胞细胞癌的预后模型,并验证关键基因识别
Chong Zhou1,2, Mingzhe Zhou1,2, Yuzhou Luo1,2
1Laboratory of Medical Genetics, Harbin Medical University, Harbin 150081, China.
International journal of molecular sciences
|October 29, 2025
概括
一个新的甘氨基基转移酶风险评分 (GTRS) 模型准确地预测了清细胞细胞癌 (ccRCC) 患者的结果. 这种工具有助于分层患者,并了解糖基化.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 清细胞细胞癌 (ccRCC) 是一种侵袭性癌亚型.
- 糖转移酶基因在细胞过程和癌症发育中至关重要.
研究的目的:
- 开发使用糖转移酶基因的ccRCC的预后模型.
- 确定关键基因并评估它们在ccRCC进展中的作用.
主要方法:
- 从公共数据库中收集了糖转移酶基因.
- 分析了ccRCC数据集中的RNA-seq数据和临床信息.
- 使用机器学习算法构建和验证预测模型,包括StepCox[forward]+Ridge.
主要成果:
- 开发了具有高预测准确度 (C指数 = 0.753) 的甘氨基基转移酶风险评分 (GTRS) 模型.
- GTRS有效地将患者分为高风险和低风险组,具有不同的生存结果.
- 高风险患者显示瘤突变负担增加和免疫抑制的微环境,与较差的免疫治疗反应相关.
- 验证了TYMP和GCNT4作为关键的致癌和瘤抑制基因.
结论:
- GTRS模型是ccRCC的可靠预测工具.
- GTRS提供了关于糖化在瘤进展和免疫治疗反应中的作用的见解.
