对抗生素耐药性基因及其在经处理的废水和生物固体中的菌媒介传播的度和量化方法的比较分析

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
• 分子生物学技术分子生物学技术.

背景情况:

• 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个重大的全球健康威胁.
• 在废水和生物固体等环境样本中对抗生素耐药性基因 (ARG) 的有效监测至关重要.
• 方法的变化阻碍了在不同的环境矩阵中进行可比的ARG监测.

研究的目的:

• 为了比较两种度方法 (过离心与基沉) 和两种检测技术 (定量PCR与滴滴数字PCR) 的ARG量化疗效.
• 为了在复杂的矩阵中评估这些方法:二次处理的废水和生物固体,包括它们的相关菌体DNA.
• 为了评估特定ARG的检测:tet(A),blaCTX-M组1,qnrB和catI.

主要方法:

• 对ARG度进行过-离心 (FC) 和基沉 (AP) 的比较分析.
• 量化PCR (qPCR) 和滴滴数字PCR (ddPCR) 的比较,用于ARG检测和量化.
• 方法应用于二次处理的废水,生物固体和纯化的菌体相关的DNA部分.

主要成果:

• 基于的沉 (AP) 方法产生了比过离心 (FC) 更高的ARG度,特别是在废水中.
• 滴滴数字PCR (ddPCR) 在废水样本中显示出比定量PCR (qPCR) 更高的灵敏度.
• 在废水和生物固体的菌体部分中检测到ARG,而ddPCR通常提供更高的检测水平.

结论:

• 方法选择显著影响基于矩阵类型 (废水与生物固体) 的ARG回收和检测灵敏度.
• 基于的降水和ddPCR显示出在环境组件中加强ARG监测的希望.
• 综合监测策略需要优化和可比的方法来准确监测ARG.