基于免疫相关基因的免疫基因分类以及结直肠癌存活率预测的诺莫格拉姆开发和验证
Guangzhe Shen1, Fangze Wei2, Tixian Xiao2
1Department of Anorectal, First Affiliated Hospital of Changchun University of Traditional Chinese Medicine, Changchun, China.
Translational cancer research
|October 29, 2025
概括
这项研究确定了与免疫相关的生物标志物,以预测结直肠癌 (CRC) 存活率. 一种新的风险评分模型根据免疫特征准确区分患者的预后,有助于个性化治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 是一个主要的全球健康问题,排名第三最常见的消化癌.
- 免疫系统活动显著影响CRC的发展和进展.
- 确定可靠的预后生物标志物对于有效的CRC管理至关重要.
研究的目的:
- 探索与免疫相关的结直肠癌预后生物标志物.
- 开发基于免疫基因组数据的患者生存预测模型.
主要方法:
- 单样样本基因组丰富分析 (ssGSEA) 用于计算免疫分数,并将患者分为高和低免疫分数组.
- 权重基因联合表达网络分析 (WGCNA) 以确定预后相关的基因模块.
- 从RNA测序中整合差异表达基因 (DEG) 与WGCNA结果,以识别与免疫相关的差异表达基因 (IRDEG).
- 应用LASSO和多变量考克斯回归来构建预后风险评分模型和名图.
主要成果:
- 患者被分为高和低免疫评分组;低免疫评分组表现出明显更好的生存率 (P<0.0001).
- 使用26个枢纽差异表达基因开发了一个风险评分模型,证明了良好的预测准确性,1年,3年和5年的AUC分别为0.75,0.73和0.65.
- 综合风险评分和临床数据的诺米图显示出强大的预测能力,1年,3年和5年的AUC分别为0.809,0.804和0.794.
结论:
- 免疫基因组分类有效地区分CRC患者的不同免疫状态.
- 开发的风险评分模型和名图是预测结直肠癌总生存率的宝贵工具.
