替代拼接免疫签名用于检测外围血液单核细胞中的HBV相关肝细胞癌
Noah J Daniels1,2, Courtney E Hershberger1,2, Daniel M Rotroff1,2,3
1Department of Quantitative Health Sciences, Cleveland Clinic Research, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA.
Biochemistry and biophysics reports
|October 29, 2025
概括
通过在外周血液单核细胞 (PBMC) 中使用替代拼接事件,提高了肝细胞癌 (HCC) 检测. 这些拼接签名显示,作为早期肝细胞癌诊断的非侵入性生物标志物具有前途.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 是一个主要的全球健康问题,许多病例与慢性乙型肝炎病毒 (HBV) 感染有关.
- 对于早期检测和管理与HBV相关的HCC,非常需要非侵入性诊断工具.
- 周围血液单核细胞 (PBMCs) 显示特定疾病的替代拼接变异,可以作为诊断生物标志物.
研究的目的:
- 识别和验证与HBV相关的HCC相关的PBMCs中与免疫相关的替代拼接事件 (ASE).
- 开发一种诊断模型,使用PBMC拼接特征来区分与HBV相关的HCC与其他疾病.
主要方法:
- 进行了从患有HBV相关的HCC,慢性HBV,其他肝脏疾病和健康对照的患者的PBMC转录组的元分析.
- 分析了与HCC和瘤阶段相关的免疫细胞组成变化和ASE.
- 一个随机的森林分类器被训练使用八个关键的免疫相关的ASE在一个大样本集和验证跨多个独立的队列.
主要成果:
- 在患有HBV相关HCC的个体的PBMC中发现了可复制的与免疫相关的ASE.
- 随机森林分类器在区分与HBV相关的HCC方面取得了很高的准确性,在交叉验证 (AUC:0.97),内部验证 (AUC:0.99) 和外部验证 (AUC:1.00) 中表现出色.
- 该模型成功地将与HBV相关的HCC与慢性HBV,非HBV肝病和健康对照区分开来.
结论:
- PBMC拼接签名代表了一种有希望的,非侵入性的生物标志物方法,用于早期检测和监测与HBV相关的HCC.
- 已识别的ASE和开发的分类器为改善肝癌管理的诊断策略提供了潜在的工具.
- 这项研究强调了PBMCs转录组分析在识别HCC等复杂疾病的新生物标志物的实用性.
