识别两足动物中的新型DNA吸附体,并使用分散固相提取方法开发用于吸附体的样品准备.
Zareen Khan1, Elena Gorokhova1, Giulia Martella1
1Department of Environmental Science, Stockholm University, Stockholm SE-106 91, Sweden.
Environmental science & technology
|October 30, 2025
概括
研究人员开发了使用两足动物进行环境暴露评估的新DNA adductomics 方法. 分散固相提取 (d-SPE) 改善了样品清洁和检测敏感性,在具有挑战性的矩阵中检测DNA附加物.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 分析化学 分析化学
- 毒理学 毒理学 毒理学
背景情况:
- 环境DNA附带学对于暴露评估至关重要,但在不同的样本类型中面临着挑战.
- 使用LC-HRMS进行DNA附带组分析的现有方法在样本清理方面存在困难,特别是在非哺乳动物物种中.
- 两足动物等物种的状和富含脂质的组织为DNA提取和分析提供了一个困难的矩阵.
研究的目的:
- 通过集成软件和数据库来增强未知的DNA附带的结构识别.
- 评估分散固体相提取 (d-SPE) 作为一种有效的清洁方法,用于在甲动物样本中进行DNA adductome分析.
- 改进DNA吸附学方法,以便在各种环境矩阵中准确评估暴露.
主要方法:
- 集成的开源软件nLossFinder与DNA补充数据库用于结构性识别补充.
- 利用精确的质量数据和MS2碎片化来区分核添加物.
- 引入并评估使用Z-sep+吸附剂进行散射固体相提取 (d-SPE) 进行样本清理.
主要成果:
- 成功识别了16个DNA添加物,包括两动物DNA的10个新奇修饰.
- 通过使用d-SPE显著减少矩阵干扰 (例如,脂).
- 达到了高达170%的LC-HRMS信号响应对DNA adducts的增强,提高了灵敏度.
结论:
- 综合数据分析工作流和d-SPE为环境监测中的DNA adductomics提供了一个强大的方法.
- d-SPE提供了一种简单的,高通量替代传统清洁方法,适合具有挑战性的矩阵.
- 这些进步使得在各种物种和环境条件下进行更准确,更全面的暴露评估成为可能.
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