开发一种精确的检测方法来检测血清HBVRNA和SP1变异在CHB中,基于长读测序
Yueyue Chen1, Mengchun Wang1, Lijuan Wu2
1Key Laboratory of Molecular Biology on Infectious Diseases, Ministry of Education, 109#, Chongqing Medical University, Chongqing, Yuzhong District, China.
Journal of medical virology
|October 30, 2025
概括
长读测序揭示了新的HBV拼接pgRNA变体,SP1是最丰富的. 核胺类比治疗降低了拼接的pgRNA和SP1水平,与肝炎相关.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 肝病学 肝病学是一种肝病学.
背景情况:
- 在乙型肝炎病毒 (HBV) 感染中拼接的pgRNA变异的作用和量化,特别是在核胺模拟剂 (NA) 治疗下,仍然不完全理解.
- 目前用于定量HBVRNA和SP1等特定拼接变异的方法缺乏足够的灵敏度和准确性.
研究的目的:
- 在HBV感染患者中,包括那些未接受治疗和接受NA治疗的患者中,使用长读测序来表征拼接的pgRNA变异.
- 开发和验证一种用于检测血清HBVRNA和SP1变异的敏感和准确的测定方法.
- 调查SP1变种水平与肝炎之间的关联.
主要方法:
- 采用长期阅读的测序策略来识别和分析HBV感染患者的拼接pgRNA变异.
- 基于长期阅读的测序发现,开发了一种用于血清HBVRNA和SP1检测的新型检测法.
- 在未接受治疗的和未接受NA治疗的患者中,使用特定的原料组验证了试验的量化一致性.
主要成果:
- 确定了16种已知的和41种新的拼接pgRNA变体,其中SP1是最丰富的 (35-62%的HBV拼接RNA).
- 在短期的NA治疗后,观察到拼接pgRNA/总HBVRNA和SP1/HBVRNA的比例下降.
- 在血清HBV RNA量化中表现出良好的一致性,并发现SP1/HBV RNA比例与肝炎严重程度相关.
结论:
- 长读测序提供了对HBV感染中的拼接pgRNA变异及其在NA治疗期间的动态变化的全面描述.
- 开发的测定提供精确检测血清HBVRNA和SP1,有助于患者监测.
- 在感染HBV的患者中,SP1变异水平可能作为肝炎的潜在生物标志物.
