手动隔离帕氏遗传卵细胞与比较转录组学相结合,以识别Tripsacum中的帕氏遗传基因

科学领域:

• 植物生物学 植物生物学
• 生殖生物学 生殖生物学
• 遗传学 遗传学是一种遗传学.

背景情况:

• 伴生,从未受精的卵子中发育胚胎,对于apomixis (通过种子进行无性繁殖) 是至关重要的.
• 草 (Tripsacum dactyloides) 是一个有价值的模型,用于研究因其高率的apomixis因其高率的parthenogenesis.
• 鉴定参与 partenogenesis 的基因是具有挑战性的,特别是在具有不可用基因组的非模型生物中.

研究的目的:

• 开发和介绍一种新的策略,用于识别非模型物种中的伴生基因.
• 为了使基因表达在伴生遗传与性卵细胞的研究.
• 为阐明植物无性繁殖的遗传基础提供一个框架.

主要方法:

• 从Tripsacum加入中手动分离了个别的伴生和性卵细胞.
• 从少量的细胞中生成RNA测序数据.
• 将RNA-seq数据映射到相关物种 (玉米) 的基因组中进行比较分析.
• 开发转基因方法来验证候选基因和生殖模式.

主要成果:

• 建立了一种方法来识别候选 partenogenesis 基因,使用被切割的卵细胞的 RNA-seq 来识别.
• 比较基因组学方法允许在没有Tripsacum基因组序列的情况下进行基因鉴定.
• 转基因方法被提议用于识别基因的功能验证.

结论:

• 描述的策略提供了一种可行的方法来识别控制非模型植物中 partenogenesis 的基因.
• 这种方法有助于研究植物无性繁殖背后的遗传机制.
• 使用转基因技术的进一步研究可以阐明候选基因在繁殖中的功能.