在体外鉴定芳香SAM依赖的C-甲基转移酶NapB5的特性

科学领域:

• 自然产品生物合成 自然产品生物合成
• 酶学 是一种酶学.
• 结构生物学 结构生物学

背景情况:

• 芳香多基基合成酶 (PKS) 产生各种自然产品.
• 依赖S-Adenosyl-l-methionine (SAM) 的C-甲基转移酶 (C-MTs) 是天然产品多样化中的关键酶.
• 纳皮拉迪奥米辛是一种具有复杂结构的美罗特类天然产品.

研究的目的:

• 为了描述来自Streptomyces aculeolatus的C-甲基转移酶NapB5.
• 阐明NapB5.5中基质选择性的机制.
• 为了了解自然产品的多样性,在其他actinomycetes中识别同类C-MTs.

主要方法:

• 纳普B5酶活性的生物化学表征.
• 结构引导的突变发生和蛋白质-连接体对接研究.
• 在actinomycetes中对基因集群的比较分析.

主要成果:

• 纳普B5催化了1,3,6,8-四氧甲 (T4HN) 的C2单甲基化.
• 在实验室中,NapB5表现出T4HN和flaviolin的化学选择性C-二甲基化.
• 酶结构和基质定位对于区域和化学选择性至关重要.

结论:

• 纳普B5的选择性取决于相对于SAM甲基供体的精确基质定位.
• 其他动因基体中的同源C-MTs可能有助于基于纳夫托基的美特类多样性.
• 了解这些酶为产生新型天然产品类似物提供了洞察力.