使用常规显微镜使用颜色强度条形码在一轮中进行高复合空间RNA成像
Tianyi Chang1, Shihui Zhao1,2, Kunyue Deng1,2
1Biomedical Pioneering Innovation Center (BIOPIC), Peking University International Cancer Institute, School of Life Sciences, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, Academy for Advanced Interdisciplinary Studies, Peking University, Beijing, China.
Nature biotechnology
|October 31, 2025
概括
通过单回合成像 (PRISM) 在现场对RNA进行分析,可以通过扩大色彩容量,使用标准显微镜进行64倍位RNA成像. 这一突破有助于在各种生物系统中进行详细的空间转录基因分析.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 显微镜的使用方法
背景情况:
- 传统的光显微镜将空间RNA成像限制在少数道上.
- 顺序光 in situ 杂交需要复杂的仪器来进行多重复合.
研究的目的:
- 介绍一种新的方法,PRISM,用于高复合空间RNA成像.
- 使用颜色强度分级扩展RNA编码能力.
- 通过常规显微镜实现多重RNA成像.
主要方法:
- 开发了PRISM (通过单回合成像在现场对RNA进行剖析).
- 利用色彩强度分级来扩大编码能力.
- 采用半径向量过来进行代码词区分.
- 在单个回合中实现了64倍位的彩色条形码RNA成像.
主要成果:
- 证明了PRISM在多种组织中的多功能性.
- 创建了一个3D小鼠胚胎发育图谱 (E12.5-E14.5).
- 创建了一个准3D的人类肝细胞癌瘤-正常过渡景观.
- 在小鼠大脑中绘制了3D细胞图谱和亚细胞RNA定位.
- 确定了癌症相关纤维细胞在瘤免疫微环境中的作用.
结论:
- PRISM显著提高了空间RNA成像能力.
- 该方法支持使用可访问的仪器进行高度复杂的分析.
- PRISM提供了对发育生物学,癌症和神经科学的新见解.


