从GC-MS数据集中采集来自博茨瓦纳奥卡万戈三角洲的尿样中的MS-DIAL预处理,用于开采石病代谢物
Sedireng M Tawana-Ndolo1,2, Matshediso Zachariah1, Nthabiseng A Phaladze3
1School of Allied Health Professions, Faculty of Health Sciences, University of Botswana, Gaborone, Botswana.
Bioanalysis
|October 31, 2025
概括
这项研究表明,MS-DIAL软件比GC-MS数据的Metab R识别的代谢物要多得多. 这种增强的代谢物概况有助于区分与对照群感染杆菌病的儿童.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 分析化学 分析化学
- 环境健康 环境健康
背景情况:
- 来自博茨瓦纳的儿童的杆杆菌感染状况使用GC-MS进行了评估.
- 代谢物数据最初使用AMDIS/Metab R软件进行处理.
- 一个代谢物的子集可能已经错过了初始处理.
研究的目的:
- 用MS-DIAL重新挖掘代谢物以改善识别.
- 从数据集中增强已识别的代谢物的数量.
- 为了更好地区分感染和控制样本.
主要方法:
- 气色谱-质谱法 (GC-MS) 用于数据采集.
- 用MS-DIAL开源免费软件重新处理了代谢物.
- 纳夫他林和二被用作内部质量控制标准.
主要成果:
- MS-DIAL确定了99种代谢物,远远超过Metab R.据推测的13种代谢物.
- 对于内部标准,实现了高匹配系数 (>90%) 和保留时间相似度得分 (1000).
- 增强的代谢物概况有助于更清晰地区分阳性样本和对照样本.
结论:
- 与Metab R.相比,MS-DIAL提供了优越的代谢物开采能力.
- 改进的代谢物识别提高了在杆菌病中发现生物标志物的潜力.
- 这种方法推进了传染病研究的代谢分析.
