探索从基因组聚合数据库中超过80万人的临床相关变异的透率
Sanna Gudmundsson1,2,3,4, Moriel Singer-Berk5, Sarah L Stenton5,6,7
1Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA. sgudmund@broadinstitute.org.
不完整的透性,即基因变异不会引起疾病,是一个挑战. 这项研究解释了为什么大多数变种不会引起疾病,在95%的病例中发现了救援机制.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 基因组医学是基因组医学.
- 不同的解释变体.
背景情况:
- 不完全的透率在解释遗传变异方面构成了重大挑战.
- 了解不完全透对于准确的疾病风险评估至关重要.
- 研究明显不完全透的个体可以揭示影响表型表达的因素.
研究的目的:
- 调查与严重的,早期发病的,高度透的哈普隆不够性疾病相关的临床相关变异.
- 在携带疾病相关变异的个体中发现疾病表型缺失的解释.
- 在一个大队伍中评估无法解释的缺乏疾病表现的频率.
主要方法:
- 分析了734个预测的功能丧失变体在77个 haploinsufficient 疾病基因.
- 在基因组聚合数据库 (gnomAD) 版本4中使用了807,162个人的数据.
- 进行了全面的个案评估,以确定缺乏疾病表型的原因.
主要成果:
- 对于734种变体中701种 (95%) 确定了假定缺乏疾病表现的解释.
- 在研究的严重疾病队列中,无法解释的缺乏疾病表现被发现是罕见的.
- 该研究强调了详细的案例评估在变体解释中的重要性.
结论:
- 大多数明显不完全透的病例可以通过潜在的生物机制或救援因素来解释.
- 难以解释病例的罕见性强调了深入评估的力量,以避免错误地分配疾病风险.
- 这种方法对于准确解释变异至关重要,特别是在未受影响的个体中.
更多相关视频
09:34Targeted Next-generation Sequencing and Bioinformatics Pipeline to Evaluate Genetic Determinants of Constitutional Disease
Published on: April 4, 2018
11:35Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay EMSA and DNA-affinity Precipitation Assay DAPA
Published on: August 21, 2016
相关概念视频
Genome-wide Association Studies-GWAS
GWAS does not require the identification of the target gene involved in...
Incomplete Dominance
Comparing Copy Number Variations and SNPs
Copy number variations or CNVs are the structural variations that cover more than 1kb of DNA sequence. The single nucleotide polymorphism (SNP), on the other hand, is a single nucleotide change or a point mutation that is found in more than 1%...
Human Genetics
The complex relationship between genetics and psychology is observable through common biological components such...
Single Nucleotide Polymorphisms-SNPs
Next-generation Sequencing
Next-Generation Sequencing Methods
Although all next-generation methods use different technologies, they all share a set of standard features....
