基于超宽混合捕获的针对性下一代测序,用于在血液感染中检测敏感的血病原体cfDNA
Muyun Wei1,2,3, Xiangzhao Ai4, Dejian Gu5
1Department of Laboratory Medicine, Ren Ji Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, No.160 Pujian Road, Shanghai, China.
Journal of translational medicine
|November 1, 2025
概括
一种超广泛的下一代定向测序 (tNGS) 方法通过检测无细胞DNA (cfDNA) 来增强血液感染 (BSI) 诊断. 这种方法的准确性与元基因组测序 (mNGS) 相当,提供了潜在的经济选工具.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 传染病诊断 传染病诊断 传染病诊断
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 目前的下一代向测序 (tNGS) 对于在血液感染 (BSI) 中检测无病原体细胞DNA (cfDNA) 的基因组范围有限.
- 这种限制阻碍了tNGS用于有效的BSI诊断的应用.
研究的目的:
- 开发和评估一种基于捕获的超宽混合tNGS方法,用于检测血病原体衍生的cfDNA.
- 评估其对血液感染 (BSI) 的诊断适用性.
主要方法:
- 开发了一种基于超宽混合捕获的tNGS方法,利用广泛的病原体面板 (1872种病原体) 和高密度探针覆盖.
- 对208名疑似BSI患者进行了回顾性测试,将tNGS与元基因组测序 (mNGS),常规微生物学测试 (CMT) 和临床诊断进行了比较.
主要成果:
- 对病原体检测的超宽tNGS和mNGS之间的一致性为93.75%.
- tNGS的诊断准确度与mNGS (76.44%与75.00%) 相当,并且在BSI方面明显高于CMT (45.67%).
- 在免疫功能低下的患者中,tNGS的准确性与mNGS相似 (77.70%与76.98%对比).
结论:
- 基于超宽混合捕获的tNGS提供了与mNGS用于BSI诊断的灵敏度和准确性相美.
- 该方法涵盖了广泛的病原体,并显示出作为BSI经济查工具的潜力.
