冷保存对PBMCs转录组特征的影响

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 细胞生物学 细胞生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 低温保存对于长期存储生物标本至关重要.
• 优化冷保存可以最大限度地减少损伤并保持细胞功能.
• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 提供了对细胞异质性的更深入的见解.

研究的目的:

• 为优化外周血液单核细胞 (PBMC) 的冷保存和恢复条件.
• 用scRNA-seq. 评估冷保存对PBMC活力,种群组成和转录组形状的影响.
• 为了评估PBMC在6个月和12个月的冷保存后的稳定性.

主要方法:

• 周围血液单核细胞 (PBMC) 被冷保存长达12个月.
• 细胞活力被评估使用青和化 (PI) 染色与FACS.
• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 在新鲜和冷保存的PBMC上进行,以分析细胞群和转录组.

主要成果:

• 在新鲜和冷保存的PBMC中确定了六种主要的免疫细胞类型.
• 在6个月和12个月的冷保存后,所有免疫细胞类型的细胞活力保持稳定.
• 在12个月后,scRNA-seq细胞捕获效率下降了~32%,转录组变化最小 (<两个折叠).

结论:

• 一个优化的冷保存和恢复程序有效地保持了PBMC的生存能力和人口组成长达12个月.
• 虽然scRNA-seq细胞捕获效率在长时间冷保存后下降,但转录组形状在很大程度上不受影响.
• 优化的方法确保对PBMC完整性和长期存储功能的影响最小.