基于线粒体相关基因的高血压病诊断模型的构建和验证,使用机器学习与WGCNA结合使用
Gonglin Tang1, Guixin Ding1, Li Xie2
1Department of Urology, The Affiliated Yantai Yuhuangding Hospital of Qingdao University, NO. 20 East Yuhuangding Road, Yantai, 264000, Shandong, China.
International urology and nephrology
|November 3, 2025
概括
研究人员确定了关键的线粒体相关基因 (MRG),并开发了高血压脏病 (HTN) 的高度准确的诊断模型. 这一发现为诊断这种病提供了潜在的新生物标志物.
科学领域:
- 基因组学和生物信息学
- 腎臟病學 (nephrology) 是一種醫學專業.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 高血压性病 (HTN) 是衰竭的重要原因,目前的诊断方法由于缺乏可靠的生物标志物而受到限制.
- 线粒体相关基因 (MRG) 在HTN的发病过程中起着至关重要的作用.
- 确定HTN的新诊断和治疗点是必不可少的.
研究的目的:
- 确定高血压脏病 (HTN) 的新型诊断和治疗点.
- 研究线粒体相关基因 (MRG) 在HTN病变发生过程中的作用.
- 使用机器学习算法开发HTN的诊断模型.
主要方法:
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 用于分析来自GSE37460数据集的差异表达基因 (DEG) 和MRG.
- 进行了KEGG,GO和GSEA丰富分析,以了解差异基因的功能.
- 机器学习算法 (LASSO,SVM,RF) 用于构建诊断模型,ssGSEA 用于功能分析.
主要成果:
- 总共有695个DEG被确定,其中14个被确定为MRG.
- 构建了一个由三个基因 (PYCARD,NRP1和IFI27) 组成的诊断模型,实现了高诊断精度 (AUC = 0.998).
- 鉴定到的枢纽基因与涉及炎症,新陈代谢和细胞信号传递的途径有显著的相关性.
结论:
- 这项研究阐明了MRG在HTN病变发生过程中的参与.
- 开发了一种具有高精度的HTN新型诊断模型.
- 这些已识别的基因有可能成为高血压脏病的可靠诊断和治疗标.
