来自乌克兰Dnipro的CF儿科患者的呼吸道病原体的基因组和表型表征
Dmytro Stepanskyi1, Oksana Ishchenko2, Patrick McGann3
1Department of Microbiology, Virology, Immunology, Epidemiology and Biomedical Physics and Informatics, Dnipro State Medical University, Dnipro, Ukraine. dstepanskiy@gmail.com.
BMC pulmonary medicine
|November 5, 2025
概括
囊性纤维化患者的慢性感染是复杂的. 这项研究确定了特定的细菌菌株,包括金黄色葡萄球菌ST398的小殖民地变体 (SCV) 和高毒的Klebsiella pneumoniae,突出了基因组监测的必要性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 临床医学 临床医学
背景情况:
- 囊性纤维化 (CF) 患者的慢性感染是由适应性,耐药性细菌系驱动的.
- 了解细菌序列类型 (ST) 和表型适应,如小殖民地变体 (SCV),对于有效的CF患者管理至关重要.
研究的目的:
- 来自乌克兰的儿科CF患者呼吸道细菌病原体的遗传和表型多样性的特征.
- 识别特定的序列类型 (ST) 和抗菌素耐药性 (AMR) 基因.
- 调查小殖民地变种 (SCV) 和高病毒性菌株的出现.
主要方法:
- 全基因组测序 (WGS) 和多位置序列类型 (MLST) 用于分析来自12名儿科CF患者的17种细菌分离物.
- 现型特征,包括SCV形态和AMR基因的特征.
- 隔离物包括金黄色葡萄球菌,Pseudomonas aeruginosa,Serratia marcescens,Enterobacter hormaechei和Klebsiella pneumoniae. 它们的分离物中含有多种类型.
主要成果:
- 黄金葡萄球菌ST398分离物 (n=2) 呈现SCV表型,增长率降低和密集的殖民地形态.
- 在Pseudomonas aeruginosa菌株中发现了多种ST.
- 一种高毒性Klebsiella pneumoniae ST23-KL1分离物含有特定的毒性因子 (siderophores, peg-344).
结论:
- 这项研究揭示了影响乌克兰CF儿童的呼吸道病原体的显著遗传和表型复杂性.
- 发现了ST398 SCVs的出现和高病毒性Klebsiella pneumoniae血统的引入.
- 建议对乌克兰CF队伍进行定期的基因组监测,以指导临床管理.


