蛋白质基因组表征揭示了结直肠转移到肝脏中的代谢脆弱性和异常酸化
Wensi Zhao1, Lei Zhao1, Yannan Lian2
1Translational Research Institute of Brain and Brain-Like Intelligence, Shanghai Fourth People's Hospital, and Cancer Center, School of Medicine, Tongji University, Shanghai, 200434, China.
Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
|November 6, 2025
概括
这项研究揭示了结直肠肝转移 (CRLM) 的关键分子驱动因素,确定了SHMT1和NDRG1作为癌症进展中的关键参与者. 发现了两种不同的CRLM蛋白质亚型,为结直肠癌 (CRC) 提供了新的预后生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 结肠直肠肝转移 (CRLM) 是结肠直肠癌 (CRC) 患者的主要死亡原因.
- 驱动CRLM的分子机制,特别是在蛋白质和蛋白质层面,尚不清楚.
研究的目的:
- 通过全面的蛋白质基因组方法阐明CRLM的分子基础.
- 确定CRLM的新型治疗标和预后生物标志物.
主要方法:
- 在102个未接受过治疗的CRLM患者样本上进行蛋白质基因组分析 (基因组学,转录组学,蛋白质组学,光蛋白质组学).
- 使用CRC细胞系,器官,小鼠模型和独立患者队列的验证.
- 无监督的聚类用于识别蛋白质组亚型.
主要成果:
- 蛋白质组学和光蛋白质组学揭示了肝转移中的重要途径失调,特别是在碳代谢中.
- 通过AMPK抑制,SHMT1促进CRC瘤发生和转移;依赖PIM激酶的NDRG1酸化加剧了肝转移.
- 确定了两个蛋白质组亚型 (C1:代谢,预后不佳;C2:RNA功能,预后更好).
- FTCD,GPD1,SOD2和EIF4BSer422酸化被验证为亚型预后生物标志物.
结论:
- 这项研究为CRLM分子机制提供了关键的见解.
- 确定了SHMT1和NDRG1作为关键驱动因素和潜在的治疗点.
- 发现并验证了CRLM预后的蛋白质组亚型和生物标志物.
