微卫星不稳定性检测各种方法之间的差异的定性和定量方面
M Staninova-Stojovska1, N Matevska-Geshkovska1, E Krstevska-Bozhinovikj1
1Center for Biomolecular Pharmaceutical Analysis, Faculty of Pharmacy, University "Ss. Cyril and Methodius" in Skopje, RN Macedonia.
下一代测序 (MSI-NGS) 提供了一种比传统的IHC和MSI-PCR测试更精确的方法来检测缺陷不匹配修复 (dMMR). 这种定量方法可以改善林奇综合征患者的免疫治疗预测.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 免疫组织化学 (IHC) 和微卫星不稳定性PCR (MSI-PCR) 是缺陷不匹配修复 (dMMR) 测试的标准,但显示1-10%的不一致性.
- 下一代测序 (NGS) 为dMMR检测提供了敏感的,定量MSI分析 (MSI-NGS).
研究的目的:
- 为了比较使用IHC,MSI-PCR和MSI-NGS的定性和定量dMMR检测.
- 评估这些方法在林奇综合征 (LS) 相关和零星结直肠癌 (CRC) 和子宫内膜癌 (EC) 中.
主要方法:
- 对IHC,MSI-PCR和MSI-NGS进行dMMR测试的比较分析.
- 评估不同癌症类型和患者队列的定性和定量结果.
主要成果:
- 在这些方法之间观察到显著的定性和定量差异.
- 仅IHC和MSI-PCR无法在LS患者中充分检测dMMR,这是由于特定的突变特征.
- 在LS患者中,MSI-NGS揭示了MSI水平的变化,受组织类型和突变的影响.
结论:
- 为了在LS中准确解释dMMR,可能需要IHC和MSI-PCR的联合策略.
- MSI-NGS提供了更精确的dMMR分析,并可以作为新抗原水平的替代标记.
- MSI-NGS定量数据可以提高dMMR缺陷癌症的免疫治疗预测.
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