传统中医药的单细胞转录组生物活性:绘制免疫,神经和肝脏反应的地图
Shubham Singh1, Sakshi Singh2, Sayli Saw1
1School of Pharmacy, Rai University, Ahmedabad, Gujarat-382260 India.
概括
单细胞RNA测序揭示了传统中医药 (TCM) 化合物如何影响特定的免疫,神经和肝细胞. 这种精确的方法揭示了细胞特异性的药物作用,以改善草药开发.
科学领域:
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 神经科学是一个神经科学.
- 肝病学 肝病学是一种肝病学.
背景情况:
- 传统中医药 (TCM) 的生物活性具有广泛的影响,但大量的转录学隐藏了细胞特异性的作用.
- 了解细胞反应是释放TCM全部治疗潜力的关键.
研究的目的:
- 使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 来映射免疫,神经和肝细胞对特征性TCM成分的反应.
- 在单细胞水平上揭示TCM生物活性物的精确药理学.
主要方法:
- 在小鼠脏,海马和肝脏组织上使用10×基因组学.
- 用Seurat进行细胞聚类,标记物识别,差异表达和途径丰富的分析.
- 通过RT-qPCR和免疫光学验证的CellChat用于联体受体相互作用推断.
主要成果:
- 超过42,000个高质量的细胞产生了15个免疫,12个神经和10个肝脏亚型.
- 在巨细胞中,TCM诱导了NF-κB调节器,在星球细胞中诱导了神经营养基因,在肝细胞中诱导了异生物代谢.
- 路径分析表明协调的免疫肝脏排毒和神经保护信号,增强了IL-10-STAT3和库弗弗细胞交叉交谈.
结论:
- scRNA-seq有效地识别了TCM生物活性物质的细胞类型特定的药理动力学.
- 这为精确的草药药理学和合理的药物发现提供了机制基础.
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