在SLE相关的冠状动脉损伤中通过转录学和机器学习对共享的细胞毒性免疫特征进行分析

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 心血管疾病 心血管疾病
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 系统性红斑狼 (SLE) 是一种自身免疫性疾病,患上心血管并发症的风险增加.
• 冠状动脉疾病 (CAD) 与自身免疫性疾病共享炎症途径.
• 了解共享的分子机制对于管理与SLE相关的心血管风险至关重要.

研究的目的:

• 调查SLE和CAD之间共享的分子通路.
• 为了确定SLE患者冠状动脉损伤的机制.
• 发现SLE相关冠状动脉并发症的潜在诊断生物标志物.

主要方法:

• 对SLE和CAD的批量转录数据集的分析.
• 鉴定差异表达基因 (DEGs),免疫细胞透和共同表达网络.
• 使用外部队列和机器学习构建和验证诊断模型.
• 单细胞RNA-seq分析用于细胞局部化和细胞间通信.
• 在患者样本中进行定量PCR (qPCR) 验证.

主要成果:

• 确定了146种常见的DEGs,这些DEGs在与细胞毒性相关的免疫通路中被丰富.
• 在细胞毒性淋巴细胞中发现了共同的失调,包括自然杀手细胞 (NK) 和CD8+T细胞.
• 确定了11个枢纽基因,通过机器学习突出显示了GZMK和KLRK1作为核心基因.
• 为SLE和CAD开发了一种具有强大性能的诊断模型.
• 验证了GZMK和KLRK1用于SLE相关冠状动脉损伤的诊断实用性.
• 在患有CAD的SLE患者的血细胞中确认了GZMK和KLRK1的更高表达.

结论:

• SLE和CAD共享一个细胞毒性淋巴细胞驱动的分子轴.
• GZMK/KLRK1介导的免疫失调有助于SLE冠状动脉损伤.
• 作为SLE相关冠状动脉并发症的早期检测和风险分层的生物标志物,GZMK和KLRK1显示出希望.
• 需要在更大的队列中进一步验证,特别是在冠状动脉微血管功能障碍等特定子组中.