多重元基因组测序用于快速识别和监测临床样本中的病毒病原体
Yu-Siang Su1, Wei-Hsiang Tsai1, Han-Chieh Wu1
1National Institute of Infectious Diseases and Vaccinology, National Health Research Institutes, 35 Keyan Road, Zhunan, 35053, Taiwan.
BMC infectious diseases
|November 11, 2025
概括
牛津纳米孔技术测序 (ONT-Seq) 改善了临床样本中的病毒检测. 这种超基因组方法提高了已知和新兴病毒的诊断准确性和监测.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 准确的病毒检测对于临床诊断和疫情监测至关重要.
- 传统的方法,如培养和抗原测试是缓慢和有限的.
- 多重PCR面板与新型或意想不到的病毒菌株作斗争.
研究的目的:
- 评估牛津纳米孔技术测序 (ONT-Seq) 在临床样本中的病毒检测.
- 将ONT-Seq与常规临床诊断进行比较.
- 评估ONT-Seq在识别共感染和新兴病毒方面的实用性.
主要方法:
- 使用ONT-Seq对85个临床标本进行了序列独立的单个初始放大 (SISPA).
- 利用了一个长时间读取,实时,多重元基因组测序平台.
- 将测序结果与常规临床诊断进行对比,以检测一致性和同时感染.
主要成果:
- ONT-Seq显示了80%的一致性与常规的临床诊断.
- 在7%的标准检测中错过的病例中发现了共感染,包括C型流感病毒和萨波罗病毒.
- 对腺病毒阳性样本的遗传学分析显示,B3是主要的循环菌株.
结论:
- 基于ONT的元基因组测序显著提高了已知和新兴病毒的检测.
- 来自ONT-Seq的实时,公正的数据可以提高诊断准确度.
- 这种方法对于临床诊断和更广泛的病毒监测工作都是有价值的.
