开发一种基于csp的RT-qPCR方法,通过对比基因组分析对Bifidobacterium animalis进行特定量化
Di Zhang1, Jia Guo1, Xin Song1
1Shanghai Engineering Research Center of Food Microbiology, School of Health Science and Engineering, University of Shanghai for Science and Technology, Shanghai 200093, China.
Food research international (Ottawa, Ont.)
|November 11, 2025
概括
一种新的细胞表面蛋白 (csp) 实时定量逆转录PCR (RT-qPCR) 方法可以准确检测Bifidobacterium animalis益生菌. 与传统的盘子计数方法相比,这种方法提供了更好的特异性和更低的可变性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 食品科学 食品科学 食品科学
背景情况:
- 用于检测益生菌的血盘计数方法 (PCM) 具有很高的可变性,缺乏菌株特异性.
- 在混合微生物群落中区分特定的益生菌菌株是具有挑战性的.
- 准确量化Bifidobacterium animalis对于益生菌的应用至关重要.
研究的目的:
- 开发一种新的,具体的,准确的方法来定量Bifidobacterium animalis.
- 为了克服传统的盘子计数方法的局限性.
- 为了在复杂的食品矩阵中验证新方法.
主要方法:
- 对比基因组分析以确定特定物种的基因组区域.
- 设计和测试针对低对线性基因组区域的初始配对.
- 开发基于细胞表面蛋白 (csp) 的实时定量逆转录PCR (RT-qPCR) 试验.
- 对乳制品中csp方法与盘子计数方法 (PCM) 和recA方法的验证.
主要成果:
- 确定了五个局部同线性块 (LCBs),并选择了一对具有B. animalis.高特异性的csp原料对.
- 基于csp的RT-qPCR方法实现了较低的检测极限 (7.2 × 10^1 CFU/mL) 和较低的相对标准偏差 (1.08%).
- 在乳制品中,csp方法提供了与PCM和recA方法相似的结果,证明了其在复杂的食品矩阵中可应用.
结论:
- 开发的基于csp的RT-qPCR方法是PCM的一个具体而准确的替代方法,用于定量Bifidobacterium animalis.
- 这种方法克服了传统技术的局限性,在复杂的食品样本中提供了更高的可靠性.
- 该csp方法具有很大的潜力,可以在食品工业中常规应用,用于益生菌质量控制.
