通过多条码纳米孔测序,在现场快速识别通用脊椎动物物种
Emily C Patterson1, Sandrella Morrison-Lanjouw2,3, Mark A Jobling1
1Division of Genetics & Genome Biology, School of Biological & Biomedical Sciences, University of Leicester, United Kingdom.
PloS one
|November 11, 2025
概括
一种新的DNA测序方法,VeRIF-ID,可以从野生动物产品中快速地在现场识别物种. 这种工具通过负担得起的便携式技术打击非法野生动物贸易和动物传染病风险.
科学领域:
- 保护遗传学 保护遗传学
- 法医科学 法医科学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 非法野生动物贸易 (IWT) 对生物多样性和公共健康构成重大威胁.
- 目前基于DNA的物种识别方法耗时,昂贵,需要实验室设施.
- 迫切需要快速的现场识别工具来打击内运水运.
研究的目的:
- 开发和验证VeRIF-ID (通过DNA进行脊椎动物快速现场识别),这是一种用于快速现场物种识别的新方法.
- 为了能够准确识别被贩运的野生动物物种,即使是从加工或损坏的样本.
- 为现场物种识别提供一个具有成本效益和便携性的解决方案.
主要方法:
- 同时在现场对四个线粒体DNA条形码进行纳米孔测序,使用专门设计的原料.
- 简化DNA提取,PCR和图书馆准备用于快速分析 (每样本<3小时).
- 使用多种脊椎动物物种进行验证,包括对传统东亚医学样本和扣押的林肉进行测试.
主要成果:
- 在测试的83种物种中,91%的VeRIF-ID实现了物种级别的识别,其余的物种是属/部落级别的识别.
- 在传统东亚医学样本中确定了危物种 (赛加鹿,黑犀牛).
- 在机场关税区在6小时内成功识别了被扣押的林肉样本中的哺乳动物和鱼类物种.
结论:
- VeRIF-ID为现场物种识别提供了一个快速,经济高效 (<48美元/样本) 和便携式解决方案.
- 该方法有效地从加工和损坏的DNA中识别物种,这对于打击非法野生动物贸易至关重要.
- VeRIF-ID有可能使物种识别实现民主化,并加强对野生动物犯罪和动物传播疾病的执法工作.
