在巨细胞中,LPS诱导低氧诱导因子-1α的有限激活
Takayuki Isagawa1, Masaki Suimye Morioka2, Hiroaki Semba3
1Data Science Center, Jichi Medical University, Shimotsuke, Japan; Division of Bioconvergence, Center for Molecular Medicine, Jichi Medical University, Shimotsuke, Japan.
The Journal of biological chemistry
|November 13, 2025
概括
低氧诱导因子-1α (HIF-1α) 的稳定在低氧和LPS刺激下通过不同的机制发生. 仅仅HIF-1α结合并不能保证基因激活;酸化和染色质状态决定了转录输出.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 低氧诱导因子-1α (HIF-1α) 对于适应低氧状态至关重要.
- 像LPS这样的炎症刺激也会影响HIF-1α,但其调节和转录活性仍然不清楚.
研究的目的:
- 研究HIF-1α在缺氧下与LPS刺激下不同的调节机制和转录活性.
- 阐明酸化和染色质修饰如何影响HIF-1α的功能.
主要方法:
- 用LPS或缺氧刺激了小鼠巨细胞.
- 进行了染色体免疫沉测序 (ChIP-seq) 和转录组分析.
- 分析包括图案丰富,H3K27乙化和酸化研究 (Phos-tag).
主要成果:
- 缺氧和LPS都通过不同的途径 (翻译后与mRNA表达) 稳定了HIF-1α蛋白.
- 低氧诱导广泛的基因激活和合作转录因子结合,以及允许的染色体标记 (H3K27ac).
- LPS上调调节了一组有限的基因,表现出明显的表观遗传抑制,并且没有诱导HIF-1α的结构变化.
结论:
- 结合HIF-1α是必要的,但不足以激活基因.
- 酸化和染色质环境以一种依赖于刺激的方式批判性地决定HIF-1α的转录输出.
