在垂直和水平传播后,宿主体内的真菌病毒种群多样性的变化
Karla Peranić1, Deborah M Leigh2,3,4, Maja Popović5
1Division of Microbiology, Department of Biology, Faculty of Science, University of Zagreb, Marulićev trg 9a, 10000 Zagreb, Croatia.
病毒种群由于突变而迅速演变. 这项研究表明,Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) 的垂直传播会导致瓶,减少多样性,而水平传播则受到真菌宿主基因型的影响.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 进化生物学 进化生物学
背景情况:
- 病毒种群表现出快速的突变率,使得快速的进化,特别是在传播事件,创造人口瓶期间.
- 克里福尼克特里亚低病毒1 (CHV1) 是一种真菌病毒,作为栗病的自然生物控制剂.
研究的目的:
- 评估CHV1种群在垂直和水平传播之前和之后的宿主内部多样性.
- 通过核酸和变体多样性指标,调查传播瓶对病毒多样性的影响.
主要方法:
- 用PacBio长期读取的HiFi测序来分析宿主内CHV1种群.
- 核酸多样性 (π) 和病毒变异多样性 (Nei's H) 被计算为量化人口多样性.
- 实验涉及垂直传播到状体和在真菌分离物之间水平传播.
主要成果:
- 冠状病毒1亚型 (法国1和意大利) 的垂直传播导致显著的瓶效应,减少突变多样性 (π).
- 垂直传播减少了亚型I的病毒变异,但增加了亚型F1.
- 横向传播多样性受真菌宿主基因型在植物性兼容性位点 (vic2和vic3) 的影响.
- 净化选择塑造了CHV1多样性,观察到的同义比非同义突变多样性更高.
结论:
- 传播瓶显著影响CHV1的多样性,对突变和变种多样性的影响因传播途径和病毒亚型而异.
- 真菌宿主基因型在水平传播期间确定病毒多样性的过程中起着至关重要的作用.
- 净化选择是维持宿主内CHV1多样性的关键力量,有利于同名突变.
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