基于Medicago sativa的转录组序列的SSR标志物的开发与盐分耐药性相关

科学领域:

• 植物遗传学 植物遗传学
• 分子生物学分子生物学
• 农业学是一种农业学.

背景情况:

• (Medicago sativa) 在种类之间表现出盐分耐受性的显著差异.
• 简单序列重复 (SSR) 对于开发针对特定特征的向分子标记有价值.
• 目前,中盐度耐受性的SSR标志物报告不足.

研究的目的:

• 为了研究中SSR位点的分布.
• 确定与盐度耐受性基因相关的关键SSR位点.
• 开发新的SSR标记物,用于基因分析的盐分耐受性.

主要方法:

• 在NaCl应力下对高盐度耐受性 (GIB) 和敏感性 (LS) 的转录基因分析.
• 识别和表征SSR位置和动图频率.
• 设计和验证SSR启动器对.
• 使用经过验证的SSR标记物进行多态性分析和草品种的分类.

主要成果:

• 在28,039个单基因中,共发现了38370个SSR位点,其中单核酸,三核酸和二核酸重复是最常见的.
• 1947个单基因被确定为盐度响应差异表达单基因 (DEU).
• 从188个与盐度耐受性相关的DEU中获得的6个SSR位点被验证为具有高多态信息含量 (0.640-0.807) 的多态标记.
• 这六个SSR标记器成功地将四种子品种根据它们的盐分耐受性分为三组,与以前的评估保持一致.

结论:

• 该研究确定了与的盐度耐受性相关的新型SSR标志物.
• 这些SSR标记物为子育种中标记辅助选择和遗传分析提供了有效的工具.
• 这一发现为进一步研究中盐度耐受性的遗传基础奠定了基础.