使用下一代定向测序来快速检测呼吸道密码球菌
Chaowen Deng1, Miaoling Qiu2, Qingyan Yang3
1Department of Infectious Diseases and Microbiology, The University of Hong Kong-Shenzhen Hospital, Shenzhen, Guangdong, China.
PLoS neglected tropical diseases
|November 17, 2025
概括
与传统方法相比,目标下一代测序 (tNGS) 提供了较高的灵敏度和更快的肺结核病诊断. 这种先进的分子技术有助于检测血清抗原测试遗漏的感染,改善患者的治疗结果.
科学领域:
- 医学真菌学 医学真菌学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 新型菌是一种关键优先级的真菌病原体,可引起菌病,由于诊断延迟,往往导致致命的脑膜炎.
- 目前的诊断方法,如真菌培养和血清加密球菌抗原 (CrAg) 测试,在灵敏度和速度上都有局限性.
研究的目的:
- 评估针对性下一代测序 (tNGS) 的临床实用性,用于使用呼吸道样本诊断肺部密码球菌病.
- 为了比较tNGS的诊断性能和周转时间与真菌培养和血清Crag检测.
主要方法:
- 这是一项追溯性研究,涉及39名38个月内被证实患有密码菌病的患者.
- 使用tNGS,真菌培养和血清CrAg测试对呼吸道样本进行分析.
主要成果:
- tNGS在92.3%的呼吸道样本中检测到C. neoformans,显著超过真菌培养 (23.1%).
- tNGS在12个CrAg阴性和9个培养阴性病例中确定了病原体,提高了诊断产量.
- 对于tNGS的平均周转时间 (23小时) 远远短于真菌培养 (112小时).
- 在76.9%的病例中,tNGS检测到多微生物感染.
结论:
- 与真菌培养相比,呼吸器标本的tNGS提供了更高的灵敏度和明显更短的循环时间来诊断密码球菌病.
- tNGS可以在CrAg阴性病例中提前诊断,提高了这种被忽视的真菌病原体的检测率.
